Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp1P58466 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms