Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms