Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtnsP57757 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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