Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms