Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp25P57080 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms