Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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