Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gp1bbP56400 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gp1bbP56400 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gp1bbP56400 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gp1bbP56400 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gp1bbP56400 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gp1bbP56400 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gp1bbP56400 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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