Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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