Protein–RNA interactions for Protein: P49764

Pgf, Placenta growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgfP49764 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PgfP49764 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PgfP49764 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PgfP49764 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PgfP49764 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PgfP49764 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms