Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp3P49194 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms