Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfx2P48379 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms