Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VhlP40338 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VhlP40338 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VhlP40338 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VhlP40338 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VhlP40338 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VhlP40338 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms