Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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