Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RxraP28700 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RxraP28700 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RxraP28700 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RxraP28700 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RxraP28700 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RxraP28700 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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