Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms