Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms