Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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