Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms