Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms