Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms