Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HdcP23738 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HdcP23738 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms