Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NfyaP23708 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms