Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hoxd8P23463 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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