Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EmbP21995 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EmbP21995 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EmbP21995 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EmbP21995 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EmbP21995 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms