Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou3f1P21952 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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