Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms