Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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