Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms