Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DmdP11531 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DmdP11531 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms