Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl2P10889 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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