Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms