Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms