Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms