Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UbbP0CG49 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms