Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf1P09925 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms