Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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