Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04214 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04214 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04214 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04214 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04214 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04214 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04214 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04214 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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