Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01734 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01734 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01734 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01734 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms