Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01645 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01645 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01645 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01645 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01645 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01645 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01645 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01645 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01645 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01645 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01645 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01645 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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