Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01644 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01644 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01644 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01644 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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