Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms