Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lnx1O70263 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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