Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ptpn20O55082 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ptpn20O55082 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ptpn20O55082 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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