Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CrxO54751 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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