Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EdaO54693 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EdaO54693 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms