Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms