Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TnxbO35452 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms