Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xbp1O35426 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xbp1O35426 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms