Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh2d1bO35324 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms