Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms